Управление МБОУ СОШ № 16 осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности. Единоличным исполнительным органом МБОУ СОШ № 16 является директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью МБОУ СОШ № 16.

    В МБОУ СОШ № 16 сформированы коллегиальные органы управления: Управляющий совет, Педагогический совет, Общее собрание работников МБОУ СОШ № 16, общешкольный  Родительский  комитет.

    Обучающиеся имеют возможность участвовать в управлении школой через деятельность в управляющем совете, педагогические работники - через деятельность в Управляющем совете и Педагогическом совете, родители - через деятельность в Управляющем совете и Родительском комитете, работники школы - через деятельность на Общем собрании работников МБОУ СОШ № 16.